妄想症和精神分裂
有些强迫症个体表现出来的强迫思维也具有妄想特征。有5%的强迫症病人坚信他们的强迫思维是真实的，另外20%的人也相信，但是没有到坚信的地步。因此，我们在诊断的时候必须考虑用缺乏“自知力”这个标准，来诊断那些对自己的思维坚信不疑的病人。妄想症与强迫症的区别强迫症会有强迫动作。因为强迫症中，强迫思维往往伴有强迫动作。
强迫思维与抑郁性沉思（depressiverumination）
对强迫思维与抑郁性沉思要做出明确区分具有一定的困难。二者的区别在于思维的内容和对思维的抵制程度不同。与强迫思维不一样，抑郁性沉思的内容是悲观的，后陷入沉思。而且，抑郁性沉思的人不太会努力来压抑这些想法，而强迫症患者会努力压制这些想法。当病人同时患有强迫症和抑郁症是，他会表现出这两种症状，但是在暴露联系中，只有强迫症状得到处理。在临床上，我们还发现，患有抑郁症的病人认为治疗是无效的，这样的观点会影响患者对治疗进展的正性评价，影响患者的积极性，虽然这与强迫症无关，但是，在治疗中，也需要的到处理。
颞叶癫痫：偶可出现强迫观念和行为，呈发作性，并有其它颞叶癫痫的症状，脑电图、脑电地形图等检查可助鉴别。
广泛性焦虑症
广泛性焦虑与强迫症在过度忧虑上就有很多相似之处，但是，与强迫思维内容不一样，过度性忧虑，其忧虑的具体内容一般在现实生活中存在，而且病人并不认同自己的忧虑是不合适的（自我协调ego syntonic），它们不会觉得它们不应该担心那些事情。而强迫思维的内容一般是虚构的，而且对这些想法病人认为是不合适的（自我不协调 ego dystonic），他们认为不应该出现这些念头。除此之外，广泛性焦虑障碍病人和强迫症病人都会担心他们日常的一些事情，比如担心他们的孩子会生病，广泛性焦虑障碍病人会担心由于生病导致的长远的后果（比如学习退步，身体衰弱等等），而强迫症患者则会注意疾病的病菌（比如他们的孩子身上的感冒病毒会大批滋生）。对于那些没有强迫动作，只有强迫思维的患者，尤其要区分忧虑与强迫思维。
恐惧症
如果不考虑仪式行为，特定的恐惧症和强迫症是很相似的。比如说，对细菌和老鼠的病人常常能够通过成功回避老鼠来降低焦虑，但是，对于强迫症病人来说，如果他带有“老鼠病毒”的强迫思维，虽然老鼠已经走了，他仍然会感觉受到细菌的感染，即便是在知道某个地方只是在几个小时前出现老鼠的情况下，也会感觉被感染。这些问题通常会导致病人随后采取回避性行为（比如大洗衣服。洗澡等）。这些行为通常在特定的恐惧症病人身上不会发生。
疑病症与身体变形障碍（body dysomorphic disorder）
疑病症的特点是对自己的健康特别关注，身体变形障碍关注的则是自己身体上有什么畸形，这两个方面也是强迫症患者强迫思维的内容。将强迫症与它们区分开来的好方法是从内容这两个方面。大多数疑病症和身体变形障碍关注的只是某一个方面的问题。而且，强迫症病人害怕将来会感染上疾病，而疑病症与身体变形障碍通常关注的是现在已有的一些问题，比如疑病症害怕自己已经生上什么病了。
抽动秽语综合症（tourette's syndrome）和其他抽搐障碍（tic disorders）
要把这两种心理障碍刻板的机体行为同强迫症区分开来，主要要分析行为与强迫思维之间的功能性关系。机体抽搐通常是自动的，其目的并不再与压制强迫思维带来的痛苦烦恼。相对来说，从行为上区分抽搐与“纯粹”的强迫动作并不容易，而且只有纯粹的强迫动作的强迫症患者也很少见。正如我们前文提到的，强迫症并发抽搐障碍的概率很高，所以对某个病人来说，在他身上往往可能同时出现两种障碍。正如抑郁性沉思一样，区分抽搐行为和强迫动作对于同时患有这两种障碍的病人来说是非常重要的，因为仪式行为阻止法的对象是强迫动作，而不是抽搐行为。
